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La actividad científico informativa en la Ciudad de la Habana estuvo dirigida de forma directa por el CNICM desde su creación en 1965, hasta que, en enero de 1977, por decisión del MINSAP y como parte de la estrategia del CNICM sobre la creación de los CPICM, se decidió fundar uno en la capital, subordinado a la Dirección Provincial de Salud. Con un total de 42 trabajadores, dirigido por el doctor Guillermo Valiente y la técnica Carolina Vega al frente de los servicios técnicos, esta institución atendía las necesdidades de información de un total de 12 hospitales clínico- quirúrgicos, seis hospitales ginecostétricos, nueve hospitales pediátricos, seis hospitales de otras especialidades, 34 policlínicos docentes, 12 policlínicos integrales y cinco unidades especializadas.

Para dar cumplimiento a su función ostensible, el CPCM funcionaba con cinco frentes, a saber, el Bibliográfico, el Departamento de Distribución, Traducciones Administración e Iconopatografía. Por otra parte, atendía administrativamente al personal de la BMN, aun cuando ésta mantenía su categoría como tal en el nivel central. A finales de 1978, este personal pasó a ser de nuevo dirigido por el CNICM.En esa etapa se procesaban cada mes más de 500 documentos de literatura médica cubana, traducciones, bibliografías y paquetes informativos. Entre las muchas otras tareas desarrolladas en el período procede mencionar el apoyo a las actividades de las bibliotecas de hospitales con diapositivas; la impartición de seminarios a la red provincial de bibliotecas para su actualización en materia de servicios informativos; la celebración de seminarios-talleres a las unidades de la red en apoyo a las actividades de educación y formación de usuarios; la edición de boletines provinciales y a nivel de base; la divulgación en la prensa plana, específicamente en el periódico Tribuna de La Habana, de la gestión del centro y la celebración cada dos años de Jornadas Provinciales de Bibliotecas Médicas

.A finales de la década de 1980, la Dirección del CNICM determinó disolver el CPICM de Ciudad de la Habana y volver a atender directamente las tareas que éste desarrollaba. En virtud de esta medida, en la Dirección Provincial de Salud quedaron sólo dos funcionarios a cargo del nombramiento y la actualización de la plantilla de los recursos humanos de la especialidad y de la supervisión y el control metodológico a las bibliotecas del territorio, en estrecha coordinación con el Departamento de Desarrollo del órgano cabecera. En los últimos años del decenio de 1990, dada la necesidad de que el CNICM se concentrara en sus funciones principales y por la complejidad de la red en la capital, se dieron los primeros pasos para volver a crear el CPICM de Ciudad de La Habana. A partir del año 2003, un pequeño equipo en la Vicedirección de Docencia de la provincia asumió la responsabilidad de la red de bibliotecas de las unidades de subordinación provincial. Finalmente, por indicación del MINSAP, Dirección Provincial asignó locales para la creación del CPICM en octubre de 2004.

Actualmente la red de Información de Ciencias Médicas en la Ciudad de La Habana está constituida por las bibliotecas de los Institutos de Investigación, de las Facultades de Medicina, de los hospitales, policlínicos, Politécnicos de la Salud y de otras unidades que comprenden los diferentes niveles de la atención médica. Cada una de ellas atiende segmentos con características diferentes.En estos momentos se está en espera de la aprobación y completamiento de la plantilla y de que se dote a la institución con la tecnología necesaria para llevar a cabo las tareas que le son inherentes.